Dominant ist die römisch-katholische Glaubensrichtung, der etwa 90 % der Bevölkerung angehören, jedoch verzeichnen evangelikale Gruppen in den letzten Jahren ähnlich wie in anderen Staaten Lateinamerikas einen großen Zulauf. Die protestantische Minderheit setzt sich aus verschiedenen Traditionen zusammen; viele davon kommen aus den USA aber auch aus England, Deutschland und Holland. Neben den Gemeinden, die aus den Missionsarbeiten von Evangelikalen, Mennoniten, Lutheranern, Calvinisten und charismatischen Strömungen entstanden, existiert auch in Kolumbien ein Bistum der Episkopalkirche der Vereinigten Staaten von Amerika. Weniger vertreten sind Judentum und Islam. Etwa 1% der Bevölkerung gehört indigenen Religionen an.