Der Handel mit Deutschland erreichte im Jahr 2005 ein Volumen von 55,4 Mio. Euro, ist aber sehr einseitig: Es wurden Waren im Wert von 13,9 Mio. Euro exportiert; dagegen betrug der Wert von Importen aus Deutschland 41,5 Mio. Euro. Aus Deutschland eingeführt werden hauptsächlich Nahrungsmittel, Kunststoffe, Industriemaschinen und Druckerzeugnisse; nach Deutschland ausgeführt werden hauptsächlich Textilien und tierische Produkte. Von 1991 bis 1998 wurden einige bilaterale Wirtschaftsabkommen unterzeichnet, was die traditionell guten Beziehungen vertiefte. (Über 20.000 Mongolen wurden einst in der DDR ausgebildet.)