Infolge der Missionierung während der Kolonialzeit sind mehr als 80% der Namibier Christen, womit das Land deutlich über dem afrikanischen Durchschnitt liegt. Von ihnen sind 50% Lutheraner, 20% Katholiken, 5% Mitglieder der Niederländischen Reformierten Kirche und 5% Anglikaner. Die restlichen Christen verteilen sich auf andere kleinere Kirchen wie z.B. Baptisten, Adventisten und die aus den USA stammende African Methodist Episcopal Church. Die restlichen Einwohner insbesondere San, Himba und Caprivianer sind Anhänger ihrer traditionellen Naturreligionen. Der Islam spielt in Namibia keine Rolle, die Anzahl der Muslime in Namibia wird auf einige wenige Tausend geschätzt.