Der Río Paraguay durchfließt das Land von Norden nach Süden und gliedert es in zwei naturräumliche Teile, den dünn besiedelten Gran Chaco im Westen, der etwa 60 % der Landesfläche einnimmt und den Oriente, die Ostregion. Der Gran Chaco ist eine schwach nach Osten geneigte, von 100 m im Sumpfland am Río Paraguay allmählich auf 450 m am Fuß der Anden ansteigende quartärzeitliche Aufschüttungsebene mit einheitlichen Landschaftscharakter. Östlich des Río Paraguay erstreckt sich ein in der Cordillera de Caaguazu bis zu 700 m hohes subtropisches Tafel- und Bergland, das zu dem von paläozoischen und mesozoischen Sedimenten und mächtigen Basaltdecken, den so genannten Paraná-Basalten, bedeckten, präkambrischen Brasilianischen Schild gehört. Es bricht in einer Stufe zur fruchtbaren Paraná-Paraguay-Senke ab, in deren südlichen Teil sich weite Sumpf- und Überschwemmungsgebiete erstrecken.