Der größte internationale Flughafen heißt Brnik und liegt in der Nähe der Hauptstadt Ljubljana. Daneben gibt es zwei kleinere internationale Flughäfen, Maribor und Portorož.
Mit dem Seehafen Koper (ital. Capodistria) besitzt Slowenien Übersee-Handelsverbindungen in alle Welt und ist Durchgangsland für Waren nach Mitteleuropa. Seit längerem ist allerdings ein Schiffahrts-Korridor mit Kroatien strittig.