Verkehrsflughäfen befinden sich in Prag (9,7 Mio. PAX im Jahr 2004, Jahreszunahme 20 %), Brünn, Ostrava-Mošnov und Karlsbad. Die meisten Hauptstädte der Regionen können über Sportflugplätze angeflogen werden.
Den innerstaatlichen Flugverkehr betreibt die Fluggesellschaft ČSA, - die tschechischen Fluglinien auf der Strecke Prag, Ostrau, Brünn und Karlsbad. Man kann ebenfalls die Charter-Fluggesellschaften nutzen, die Aussichtsflüge oder den Verkehr mit kleinen Flugzeugen nach vielen Orten Tschechiens anbieten.