Die Marine (Armada Nacional) inklusive der Küstenwache (Prefectura Nacional Naval) hat eine Mannstärke von etwa 6.000 Mann. Sie ist ausgerüstet mit 3 Fregatten, 3 Patrouillen-Boote, 3 Minenräumern und anderen kleinen Booten. Zur Marine gehört auch ein Marine-Corps (Cuerpo de Fusileros Navales), welches in vier Brigaden (Kompanie-Stärke) unterteilt ist. Die Marine verwendet folgende Hubschrauber und Flugzeuge: T-34C Mentors, S-2 Trackers, Westland Wessex, Beech King Air 200 und British Aerospace Jetstream.