Der internationale Flughafen Helsinki-Vantaa liegt 15 Kilometer nördlich des Stadtzentrums in der Nachbarstadt Vantaa. Er ist der größte Verkehrsflughafen Finnlands und bedient 15 Millionen Fluggäste im Jahr. Bis zur Eröffnung des Flughafens Helsinki-Vantaa in Jahr 1952 war der Flughafen Malmi im Stadtteil Malmi 10 Kilometer nordöstlich des Zentrums der Hauptflughafen der Stadt. Heute dient er der allgemeinen Luftfahrt. Die Stadt Helsinki strebt eine Schließung des Flughafens Malmi bis zum Jahr 2010 an, um das Gebiet für den Wohnungsbau freizumachen. Die geplante Schließung ist aber äußerst umstritten. Daneben betreibt die Fluggesellschaft Copterline eine Hubschrauberverbindung vom Hafen Helsinkis nach Tallinn. Die Flugzeit beträgt circa 25 Minuten.