Die Stadt ist der traditionelle Sitz des ökumenischen Patriarchen, zu dem einige orthodoxe Kirchen gehören, und Sitz eines armenischen Erzbischofs sowie des Erzbischofs der syrisch-orthodoxen (aramäischen) Gemeinde. Der Alltag der noch in Istanbul lebenden armenischen, griechischen und aramäischen Minderheiten war nach dem Ersten Weltkrieg von Diskriminierung und ständigen Repressalien geprägt. 1942 kam es zur Einführung einer ruinösen Vermögenssteuer (varlık vergisi) für Nicht-Muslime, im September 1955 unter der korrupten Regierung von Ministerpräsident Adnan Menderes zu schweren Pogromen (Pogrom von Istanbul). 1964 wurden schließlich alle Griechen ohne türkische Staatsangehörigkeit des Landes verwiesen. Die Zahl der Armenier in Istanbul umfasst daher heute nur noch etwa 60.000, die Zahl der Griechen beläuft sich auf 2000. Neben den Levantinern gibt es auch eine kleine, verstreute Anzahl von Bosporus-Deutschen, rund um das St. Georgs-Kolleg gibt es eine österreichische, katholische Gemeinde.