Der öffentliche Busverkehr der Stadt wird von den Gesellschaften Nanjing Gongjiao, Zhongbei, Argos und Xincheng betrieben, die auf 170 Strecken alle Teile der Stadt inklusive der Vororte erschließen. Die erste Nanjinger U-Bahn-Linie nahm ihren Betrieb am 15. Mai 2005 auf, im November wurde mit dem Bau einer zweiten Strecke begonnen. Bis zum Jahr 2050 soll ein 433 km langes U-Bahn-System entstehen.