Die Stadt verfügt über einige Hochschulen. Die größte davon war die Rostower Staatsuniversität, RGU, welche bereits im Jahr 1915 eröffnet wurde. Im Januar 2007 fusioniert die RGU mit weiteren Rostower und südrussischen Universitäten zur YUFU, der Südlichen Föderalen Universität. Des Weiteren existieren pädagogische, ökonomische und medizinische Institute in der Stadt.
Fakultät der Staatlichen Akademie für Wasserstraßenverkehr des Wolgagebiets
Filiale der Belgoroder Universität der Verbraucherkooperative
Filiale der Moskauer Staatlichen Handelsuniversität
Filiale der Moskauer Staatlichen Technischen Universität für Zivilluftfahrt
Filiale der Moskauer Technischen Universität für Fernmeldewesen und Informatik
Filiale der Russischen Zollakademie
Filiale der Sankt-Petersburger Staatlichen Kunstakademie
Filiale der Taganroger Staatlichen Universität für Nachrichtentechnik
Filiale des Instituts für Internationales Recht und Ökonomie
Filiale des Moskauer Instituts für Unternehmertum und Recht
Filiale des Moskauer Staatlichen Ferninstituts der Nahrungsindustrie
Freies Russisch-Deutsches Institut für Publizistik Rostow am Don, FRDIP [1]
Institut für Business und Recht Rostow-na-Donu
Institut für Internationales Business
Institut für Verwaltung, Business und Recht
Juristisches Instituts der Donregion
Nordkaukasische Akademie für Staatsdienst
Nordkaukasisches Businessinstitut
Nordkaukasisches Institut für Anthropologie und angewandte Soziologie
Rostower Filiale der Staatlichen Technischen Universität Nowotscherkassk
Rostower Hochschule des Innenministeriums Russlands
Rostower Institut für Automatisierung und Maschinenbautechnologie
Rostower Institut für Business und Recht
Rostower Institut für Business und Unternehmertum
Rostower Institut für Fremdsprachen
Rostower Juristisches Institut
Rostower Militärinstitut für Raketentruppen
Rostower Staatliche Akademie für Bauwesen
Rostower Staatliche Bauuniversität
Rostower Staatliche Medizinuniversität
Rostower Staatliche Ökonomische Universität
Rostower Staatliche Pädagogische Universität
Rostower Staatliche Universität
Rostower Staatliche Universität für Verkehrsverbindung
Rostower Staatliches Architekturinstitut
Rostower Staatliches S.W.Rachmaninow-Konservatorium
Staatliche Agraruniversität der Donregion
Staatliche Akademie für Landwirtschaftlichen Maschinenbau Rostow-na-Donu
Staatliche Technische Universität der Donregion
Südrussisches Geisteswissenschaftliches Institut
Zentrum für Internationale Technologische Zusammenarbeit in Lehre und *Wissenschaft "Internauka"