Museo Archeologico Nazionale. Eins der weltweit bedeutendsten archäologischen Museen. Zahlreiche Funde aus Pompeji und Herculaneum, darunter viele Großplastiken und Mosaiken, unter anderem die berühmte, aus anderthalb Millionen Mosaiksteichen bestehende Darstellung der Alexanderschlacht. Enthält auch das Gabinetto Segreto ("Geheimkabinett"), ein ehemals nicht der Öffentlichkeit zugänglicher Raum mit einer Sammlung erotischer Kunst der Antike.
Museo Nazionale di Capodimonte im von den Bourbonen errichteten Palazzo Reale di Capodimonte mit angegliedertem Schlosspark. Große Gemäldegalerie mit Werken des 13. bis 20. Jahrhunderts. Unter anderem Werke von Tizian, Masaccio, Vasari, Bellini, Raffael, Botticelli, Caravaggio, El Greco und Pieter Brueghel dem Älteren.
Musei di Antropologia, Mineralogia e Zoologia dell'Unversità Federico II. Insgesamt acht recht umfangreiche und öffentlich zugängliche Lehrsammlungen der Universität.
Ferner:
Museo d'Arte Donna Regina, Museum für zeitgenössische Kunst.
Sowie weitere Museen im Stadtgebiet und in der Agglomeration um Neapel [9].